MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 2675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014214	GTCTTC	2	12	24612	24623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	297567901
502	NC_014214	GGA	2	6	24776	24781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567902
503	NC_014214	CTGG	2	8	24944	24951	0 %	25 %	50 %	25 %	297567902
504	NC_014214	ATC	2	6	24961	24966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567902
505	NC_014214	GCTC	2	8	25043	25050	0 %	25 %	25 %	50 %	297567902
506	NC_014214	GCC	2	6	25059	25064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567902
507	NC_014214	AGG	2	6	25066	25071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567902
508	NC_014214	GGT	2	6	25211	25216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567902
509	NC_014214	G	7	7	25223	25229	0 %	0 %	100 %	0 %	297567902
510	NC_014214	CGCT	2	8	25440	25447	0 %	25 %	25 %	50 %	297567902
511	NC_014214	GT	3	6	25537	25542	0 %	50 %	50 %	0 %	297567902
512	NC_014214	GAA	2	6	26829	26834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567903
513	NC_014214	CGG	2	6	26875	26880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567903
514	NC_014214	GA	3	6	26977	26982	50 %	0 %	50 %	0 %	297567903
515	NC_014214	CAG	2	6	27174	27179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567904
516	NC_014214	CTG	2	6	27192	27197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567904
517	NC_014214	GCC	2	6	27203	27208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567904
518	NC_014214	CTC	2	6	27234	27239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
519	NC_014214	CCT	2	6	27254	27259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
520	NC_014214	ACC	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567904
521	NC_014214	CCG	2	6	27284	27289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567904
522	NC_014214	GCA	2	6	27302	27307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567904
523	NC_014214	CCT	2	6	27308	27313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
524	NC_014214	GGC	2	6	27341	27346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
525	NC_014214	TCC	3	9	27349	27357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
526	NC_014214	GCT	2	6	27372	27377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567904
527	NC_014214	ACC	2	6	27424	27429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567904
528	NC_014214	CTC	2	6	27483	27488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
529	NC_014214	GAG	2	6	27510	27515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567904
530	NC_014214	CCT	2	6	27557	27562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
531	NC_014214	CTC	2	6	27627	27632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
532	NC_014214	CCAG	2	8	27644	27651	25 %	0 %	25 %	50 %	297567904
533	NC_014214	AGC	2	6	27685	27690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567904
534	NC_014214	CGG	2	6	27710	27715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
535	NC_014214	GCA	2	6	27737	27742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567904
536	NC_014214	CCT	2	6	27773	27778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
537	NC_014214	GGC	2	6	27846	27851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
538	NC_014214	GGC	2	6	27909	27914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
539	NC_014214	GAA	2	6	27987	27992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567904
540	NC_014214	TCC	2	6	28090	28095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
541	NC_014214	CCT	2	6	28148	28153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
542	NC_014214	CCA	2	6	28169	28174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567904
543	NC_014214	GGA	2	6	28175	28180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567904
544	NC_014214	CTC	2	6	28185	28190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
545	NC_014214	GAT	2	6	28245	28250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567904
546	NC_014214	CCA	2	6	28265	28270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567904
547	NC_014214	CCG	2	6	28310	28315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567904
548	NC_014214	TGC	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567904
549	NC_014214	CAC	2	6	28398	28403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567904
550	NC_014214	CCAGCT	2	12	28442	28453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567904
551	NC_014214	CCA	2	6	28481	28486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567904
552	NC_014214	GGC	2	6	28494	28499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
553	NC_014214	CCG	3	9	28500	28508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567904
554	NC_014214	CAG	2	6	28560	28565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567904
555	NC_014214	GTC	2	6	28566	28571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567904
556	NC_014214	GC	3	6	28580	28585	0 %	0 %	50 %	50 %	297567904
557	NC_014214	CTT	2	6	28593	28598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567904
558	NC_014214	CCT	2	6	28601	28606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
559	NC_014214	TCT	2	6	28631	28636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567904
560	NC_014214	TGG	2	6	28655	28660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567904
561	NC_014214	GTC	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567904
562	NC_014214	GGC	2	6	28713	28718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
563	NC_014214	GGC	2	6	28738	28743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
564	NC_014214	GAT	2	6	28764	28769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567904
565	NC_014214	GCG	2	6	28792	28797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
566	NC_014214	CCCG	2	8	28832	28839	0 %	0 %	25 %	75 %	297567904
567	NC_014214	GCAG	2	8	28856	28863	25 %	0 %	50 %	25 %	297567904
568	NC_014214	G	6	6	28901	28906	0 %	0 %	100 %	0 %	297567904
569	NC_014214	CGA	2	6	28910	28915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567904
570	NC_014214	CGG	2	6	28943	28948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567904
571	NC_014214	TTG	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567904
572	NC_014214	TCC	2	6	28987	28992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
573	NC_014214	CTC	2	6	28995	29000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
574	NC_014214	GGGCC	2	10	29066	29075	0 %	0 %	60 %	40 %	297567904
575	NC_014214	GGGA	2	8	29394	29401	25 %	0 %	75 %	0 %	297567905
576	NC_014214	TCC	2	6	29414	29419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567905
577	NC_014214	GGA	2	6	29443	29448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567905
578	NC_014214	C	7	7	29476	29482	0 %	0 %	0 %	100 %	297567905
579	NC_014214	GGA	2	6	29542	29547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567905
580	NC_014214	CTA	2	6	29593	29598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567905
581	NC_014214	GGCC	2	8	29622	29629	0 %	0 %	50 %	50 %	297567905
582	NC_014214	GGCA	2	8	29687	29694	25 %	0 %	50 %	25 %	297567905
583	NC_014214	TTCT	2	8	31452	31459	0 %	75 %	0 %	25 %	297567906
584	NC_014214	ACT	2	6	31532	31537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567906
585	NC_014214	ACC	2	6	31697	31702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567906
586	NC_014214	CCCT	2	8	31746	31753	0 %	25 %	0 %	75 %	297567906
587	NC_014214	CAC	2	6	31831	31836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567906
588	NC_014214	CT	3	6	31848	31853	0 %	50 %	0 %	50 %	297567906
589	NC_014214	GGT	2	6	31876	31881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567906
590	NC_014214	TGCT	2	8	31934	31941	0 %	50 %	25 %	25 %	297567906
591	NC_014214	GCG	2	6	31960	31965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567906
592	NC_014214	TGC	2	6	32024	32029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567906
593	NC_014214	CCCG	2	8	32046	32053	0 %	0 %	25 %	75 %	297567906
594	NC_014214	TCG	2	6	32061	32066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567906
595	NC_014214	CGT	2	6	32076	32081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567906
596	NC_014214	CCT	2	6	32126	32131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567906
597	NC_014214	GA	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	297567906
598	NC_014214	TTCC	2	8	32280	32287	0 %	50 %	0 %	50 %	297567906
599	NC_014214	CGC	2	6	32330	32335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567906
600	NC_014214	CGG	2	6	32344	32349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567906
601	NC_014214	GCG	2	6	32396	32401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567906
602	NC_014214	CAC	2	6	32413	32418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567906
603	NC_014214	CAT	2	6	32464	32469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567906
604	NC_014214	CGA	2	6	32470	32475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567906
605	NC_014214	GCC	2	6	32549	32554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567906
606	NC_014214	GT	3	6	32577	32582	0 %	50 %	50 %	0 %	297567906
607	NC_014214	GCC	2	6	32595	32600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567906
608	NC_014214	TGA	2	6	32638	32643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567907
609	NC_014214	GCG	2	6	32650	32655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567907
610	NC_014214	ACG	2	6	32695	32700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567907
611	NC_014214	CGA	2	6	32744	32749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567907
612	NC_014214	GAT	2	6	32843	32848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567907
613	NC_014214	ACA	2	6	32946	32951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567907
614	NC_014214	TAT	2	6	33004	33009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297567907
615	NC_014214	CAT	2	6	33011	33016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567907
616	NC_014214	TCC	2	6	33118	33123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567908
617	NC_014214	C	6	6	33122	33127	0 %	0 %	0 %	100 %	297567908
618	NC_014214	CCA	2	6	33134	33139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567908
619	NC_014214	GGC	2	6	33155	33160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567908
620	NC_014214	GAG	2	6	33162	33167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567908
621	NC_014214	CGG	2	6	33173	33178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567908
622	NC_014214	TCG	2	6	33181	33186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567908
623	NC_014214	TGC	2	6	33188	33193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567908
624	NC_014214	GCC	2	6	33208	33213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567908
625	NC_014214	GTC	2	6	33327	33332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567908
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627	NC_014214	GGC	2	6	33364	33369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567908
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